Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATPIF1Q9UII2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms