Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms