Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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