Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS7AQ9UBW8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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