Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF275Q9NSD4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms