Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL3Q9NQ33 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms