Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FZD3Q9NPG1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms