Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPAG4Q9NPE6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms