Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1EQ9GZS1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms