Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCP2Q9BX26 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms