Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUP58Q9BVL2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms