Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms