Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOPXQ9BPY8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms