Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms