Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP88Q99567 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms