Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CFAP53Q96M91 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP53Q96M91 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms