Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SAMD8Q96LT4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SAMD8Q96LT4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SAMD8Q96LT4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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