Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALPK3Q96L96 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPK3Q96L96 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms