Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms