Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIC2Q96JB3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms