Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAF2Q96CS3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms