Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RPUSD4Q96CM3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RPUSD4Q96CM3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RPUSD4Q96CM3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RPUSD4Q96CM3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RPUSD4Q96CM3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RPUSD4Q96CM3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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