Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms