Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP13Q92995 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP13Q92995 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP13Q92995 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP13Q92995 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP13Q92995 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP13Q92995 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP13Q92995 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
USP13Q92995 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP13Q92995 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP13Q92995 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP13Q92995 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP13Q92995 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms