Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms