Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DNAJA4Q8WW22 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms