Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG8Q8ND04 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms