Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRCQ7RTU9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms