Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms