Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms