Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC149Q6ZUS6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms