Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HACD2Q6Y1H2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms