Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms