Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRAMD4Q6IC98 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms