Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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C9orf135Q5VTT2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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C9orf135Q5VTT2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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C9orf135Q5VTT2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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C9orf135Q5VTT2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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C9orf135Q5VTT2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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C9orf135Q5VTT2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf135Q5VTT2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf135Q5VTT2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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C9orf135Q5VTT2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf135Q5VTT2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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