Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MUM1-214ENST00000591806 4067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms