Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LCN1P1Q5VSP4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms