Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3BQ5T9A4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATAD3BQ5T9A4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms