Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms