Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SDK2Q58EX2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms