Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC93Q567U6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms