Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6CQ53S08 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms