Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM259Q4ZIN3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms