Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYTL3Q4VX76 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms