Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP41Q3LFD5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms