Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms