Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL24A1Q17RW2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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COL24A1Q17RW2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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COL24A1Q17RW2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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COL24A1Q17RW2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
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COL24A1Q17RW2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
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COL24A1Q17RW2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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