Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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PTPRNQ16849 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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