Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACKR1Q16570 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms