Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC6Q16204 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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